[Job] [THESE] EQAMAT H/F - Cherbourg (50)

Annonce postée par : Gallon (regis.gallon(a)lecnam.net) ---------------------------------------- Évaluation quantitative des communautés macroalgales intertidales par télédétection Co-financement : Agence de l'eau Seine-Normandie - Région Normandie Direction de thèse : Pascal Bailly du Bois et Régis Gallon La télédétection par imagerie permet d'étudier de grandes surfaces, mais l'efficacité des satellites et des aéronefs pour la cartographie des macroalgues intertidales à petite échelle est limitée par leur résolution spatiale grossière (50cm à 3m), leur résolution spectrale limitée (Spot5 – 4 bandes, Pléiades – 5 bandes, Sentinel-2 - 13 bandes) et leur flexibilité opérationnelle restreinte (El Mahrad et al., 2020). Le développement rapide des drones (UAV) et de la technologie des capteurs peut résoudre ces problèmes et fournir une alternative potentielle. Parmi les différents capteurs les images multi-spectrales et hyper-spectrales sont couramment utilisées sur la végétation terrestre, par exemple, pour estimer les rendements des cultures, ces technologies peuvent être employées en zone intertidale pour identifier les macroalgues (Diruit et al., 2022; Douay et al., 2022; Kotta et al., 2018)(Figure 3) et estimer leur biomasse (Bel l et al., 2015; Chen et al., 2022; James et al., 2020). Cette approche permettra d’apporter une nouvelle méthodologie pour cartographier les habitats macroalgaux intertidaux en s’appuyant sur données hyper- spectrales et LiDAR. Les données hyperspectrales permettront à la fois d’identifier les macroalgues et d’évaluer la production et la productivité de ces communautés. Les acquisitions LIDAR par drone permettront d’obtenir une topographie précise des sites pour étudier la distribution altimétrique des macroalgues. Ces travaux vont donc permettre d’appréhender la capacité de résilience des systèmes en fonction de pressions et comprendre ces dernières affectent la structure des communautés et leurs conséquences sur la fonction de production. L’étude des relations biodiversité́ / production est au cœur des grandes questions relatives aux capacités de résilience des écosystèmes (Isbell et al., 2015). La thèse est structurée en 4 axes : AXE1 : Evaluation des pressions sur les sites étudiés : Le doctorant devra réaliser une synthèse bibliographique des pressions structurant les communautés macroalgales intertidales sur le littoral Normand. Il pourra s’appuyer sur l’expertise d’un comité scientifique qu’il coanimera avec les encadrants de thèse. AXE2 : Étudier la structure des communautés algales par télédétection : En s’appuyant sur le service Drone du Cnam-Intechmer, le doctorant acquerra des prises de vue aéroportées multi et hyperspectrales des neufs sites d’étude. Il complètera ces clichés par des l’acquisition d’images satellites (Pleidaes, spot). Des mesures seront également réalisées en laboratoire à l’aide d’une caméra hyper-spectrale Specim IQ (400 nm à 1000 nm, 204 bandes) pour évaluer la variabilité spécifique de la réflectance en fonction des saisons et du stade de croissance. Elles seront ensuite comparées avec des données aéroportées. Des survols avec un capteur LiDAR (Laser imaging Detection And Ranging, DJI Zenmuse L1) permettra de caractériser la topographie des sites et de discriminer des signatures hyper-spectrales très proches par l’altitude. A terme, le couplage des données aéroportées avec les données de terrain permettra de réalise r un modèle pour réaliser une cartographie des habitats macroalgaux intertidaux. Ce modèle prendra en compte les données hyperspectrales et topographiques de la zone étudiée. AXE3 : Évaluer l’état physiologique des communautés macroalgales par télédétection : Les mesures aéroportées seront calibrées par des mesures de terrain. Des quadrats seront positionnées sur l’estran pour décrire la diversité des communautés et mesurer la biomasse algale totale. Ces mesures de terrain seront complétées par des mesures hyper-spectrales en laboratoire (en complément des mesures de la tâche 2) pour estimer l’effet de la teneur en eau sur les mesures de biomasse (Che et al., 2021). La productivité sera calibrée à l’aide de cloches benthiques développées par le Cnam-Intechmer. AXE4 : Les données acquises à partir des objectifs précédents vont permettre d’élaborer un indicateur spatialisé permettant d’estimer l’état de santé des communautés algales intertidales. Localisation La thèse se déroulera à Cherbourg au sein du Cnam-Intechmer rattaché au Laboratoire des Sciences appliquées de Cherbourg (EA 4253, LUSAC). Profil recherché Le candidat devra montrer de bonnes connaissances en écologie marine et une curiosité naturaliste. La méthodologie combine différentes approches : mesures sur le terrain, expériences en laboratoire, traitement de données, modélisation numérique. La thèse s’adresse donc à une personne ayant un attrait pour l’ensemble de ces approches (même sans les avoir toutes déjà pratiquées). La capacité à analyser des données chiffrées est capitale. L’étudiant-e devra avoir une maîtrise, d’un langage de programmation (R ou Python), et surtout la motivation à apprendre à coder ou à se perfectionner. Les candidatures seront analysées au fur et à mesure de leur réception. Pour candidater (CV et lettre de motivation) ou avoir plus d’informations sur la thèse, écrivez à : regis.gallon(a)lecnam.net et pascal.baillydubois(a)lecnam.net ---------------------------------------- L'annonce est située https://georezo.net/forum/viewtopic.php?pid=359840#p359840 Pour vous désabonner connectez-vous sur le forum puis Profil / Abonnement -- Association GeoRezo - le portail géomatique https://georezo.net (Message généré automatiquement. Ne pas répondre à ce message, utiliser les coordonnées contenues dans l'annonce)