Annonce postée par : jb.feret (jb.feret(a)teledetection.fr)
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Contact: jb.feret(a)teledetection.fr
INRAE et l’UMR TETIS recrutent un(e) stagiaire de niveau M2 :
Mise au point d’un capteur optique pour le suivi du contenu biochimique foliaire : aide au
suivi de l’état physiologique et à la détection précoce de maladies.
Les pratiques agricoles doivent s’adapter aux changements climatiques, qui influencent les
pratiques agricoles par leur impact sur les températures et les précipitations. La
composition chimique foliaire est un indicateur pertinent pour suivre l’état physiologique
d’une plante, sa phénologie, et le développement de maladies dans ce contexte d’évolution
rapide des conditions environnementales.
Les avancées récentes dans le domaine de la modélisation physique des feuilles et dans
l’instrumentation optique permettent aujourd’hui d’envisager de mesurer la chimie foliaire
à l’aide d’outils portables bas cout. Le modèle PROSPECT permet ainsi d’estimer les
principaux constituants chimiques foliaires (chlorophylle, caroténoïdes, anthocyanes, eau
et matière sèche). Le suivi de cette signature biochimique permet alors de diagnostiquer
l’état des cultures, détecter le stress et la présence éventuelle de certains pathogènes à
un stade précoce. La cartographie de la chlorophylle foliaire par la télédétection est
ainsi utilisée de manière opérationnelle depuis de nombreuses années afin d’aider à la
décision dans l’itinéraire technique de l’agriculteur et dans la prévision des récoltes.
Les résultats de recherche en cours montrent qu’il est possible de parvenir à une
quantification fine de la chimie foliaire à l’aide des outils de modélisation et par
l’acquisition parcimonieuse de propriétés optiques foliaires dans le domaine optique,
permettant d’envisager de développer un capteur portable type leaf-clip basé sur un
éclairage multispectral à base de diodes laser et d’une détection synchrone multi-porteuse
(technologie brevetée par INRAE ).
L’objectif de ce stage est de définir un cahier des charges par la mise en place de
simulations permettant d’identifier l’informations spectrale pertinente, et d’élaborer un
prototype pour quantifier la chimie foliaire. Dans un premier temps, l’étudiant devra
comprendre les différents phénomènes optiques mis en jeu et s’approprier les outils de
modélisation existant . Il déterminera ensuite la combinaison de longueurs d’onde
permettant une estimation optimale de la chimie foliaire, en combinant bases de données
simulées et expérimentales disponibles. Enfin, à partir des résultats obtenus, il
développera un prototype de laboratoire. Ce système sera caractérisé et validé avec des
données expérimentales issues de différents types de culture. Ce travail permettra de
valoriser les résultats de recherche des UMRs TETIS et ITAP et pourra déboucher sur le
dépôt d’un brevet.
Concrètement, la personne retenue pour ce stage devra démontrer la capacité à :
• Effectuer un état de l’art des solutions techniques et méthodologiques envisageables
pour répondre au problème posé dans le cadre du stage
• Prendre en main les outils et méthodes disponibles pour analyser les propriétés optiques
foliaires à partir de scripts R
• Appliquer un protocole expérimental afin de tester des combinaisons optiques identifiées
lors de l’état de l’art
• Contribuer à des campagnes de mesure terrain et aux mesures en laboratoire consécutives
(mesures de propriétés optiques en laboratoire).
• Produire des rapports d’activité synthétiques réguliers
Durée souhaitée du stage
6 mois
Date indicative de début de stage
Avril 2021
Profil recherché :
Master 2 ayant des compétences dans un ou plusieurs domaines suivant :
- Agronomie / Environnement
- Optique physique & capteurs
- Développement et analyse de données (langage R)
Le/la candidat(e) devra pouvoir faire preuve d’autonomie et d’esprit d’initiative,
notamment dans le développement de programmes informatique pour utiliser les outils de
modélisation et mettre au point les schémas de simulation expérimentale (utilisation de R
fortement recommandée) ainsi que pour les campagnes expérimentales. Des campagnes de
collecte d’information sur le terrain dans la région de Montpellier seront à prévoir.
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