7 Jul
2022
7 Jul
'22
10 a.m.
Annonce postée par : RICHARD (herve.richard(a)inrae.fr)
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Ingénieur-e en géomatique dans le cadre du projet CLIMESCA
Description et modalités sur https://jobs.inrae.fr/ot-14796
Présentation de INRAE
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
(INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de
12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées
dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders
mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses
recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une
alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Environnement de travail, missions et activités
CONTEXTE
L’objectif principal du projet CLIMESCA est d’explorer et de cartographier à l’échelle
nationale le rôle du climat et de savariabilité dans l’incidence des maladies du bois de
la vigne (en particulier l’esca1) et de sa mortalité, à l’aide d’une
approchespatio-temporelle confrontant des données épidémiologiques pluri-annuelles et
parcellaires de sept régions viticoles à desdonnées climatiques. Il s’agira d’analyser les
relations entre les données climatiques et les bases de données régionales de l’incidence
des maladies du bois (2003-2022) à l’échelle nationale intégrant les données de 7 régions
(Grand Est,Centre-Val de Loire, Bourgogne -Franche- Comté, Auvergne-Rhône-Alpes,
Provence-Alpes-Côtesd’Azur, Occitanie et Nouvelle-Aquitaine). La finalité de ce projet,
réalisé dans le cadre du travail de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé
Végétale (ESV) (Groupe de travail «Surveillance Épidémiologique du Dépérissement du v
ignoble»), sera de proposer une méthode pour la collecte, la mise en forme, l’analyse et
la visualisation des données “maladies du bois”. Le travail proposé pourra être mis au
service d’autres problématiques ou opportunités sur la Plateforme ESV.
Ce projet est coordonné par l’UMR SAVE (INRAE), il se décline en 3 actions :
–Action 1 : «Création d’une base de données nationale et préconisations pour la gestion de
données» - responsable Lucia Guérin - Dubrana UMR SAVE ;
–Action 2 : «Exploration du rôle des facteurs climatiques dans le dépérissement de la
vigne» - responsable Chloé Delmas UMR SAVE ;
–Action 3 : «Cartographie et visualisation de la dynamique climatique du dépérissement du
vignoble» - responsable Hervé Richard UR BioSP.
Les missions traitées par cet ingénieur relèvent de l’action 1 et 3.
BioSP est une unité de recherche copilotée par les départements MathNum et SPE de INRAE ;
elle développe des travaux en statistique, en systèmes dynamiques, en
écologie-épidémiologie, et aux interfaces entre ces différentes disciplines avec un
intérêt particulier pour les questions spatiales et spatio-temporelles. Les domaines
d'application de ces travaux sont avant tout l'écologie, l'épidémiologie,
l'agriculture et l'environnement. L'unité est constituée de l'équipe
Recherche et de l'équipeOPE (équipeOpérationnelle à l'INRAE pour la Plateforme
d'Epidémiosurveillance en Santé Végétale). Cette plateforme est le premier réseau
fondé par les plus grands acteurs français de la santé du végétal dont l’objectif est
d’améliorer la surveillance sanitaire et biologique du territoire face aux dangers
sanitaires ou phénomènes phytosanitaires ayant un impact sur l'état sanitaire des
végétaux.
SAVE est une unité mixte de recherche interdisciplinaire entre INRAE et Bordeaux Sciences
Agro. Elle fait partie du département SPE (Santé des plantes et environnement) de INRAE.
Sa mission principale est de produire des connaissances et de développer des outils
contribuant à élaborer une protection agro-écologique du vignoble. Ses travaux reposent
sur des expertises complémentaires en écologie, phytopathologie et entomologie. Le projet
CLIMESCA sera réalisé dans le groupe «dépérissement de la vigne» qui étudie (i) les
processus sous-jacents aux interactions entre la vigne, le climat et les agents
pathogènes (maladies du bois en particulier) et les leviers de gestion du dépérissement,
(ii) l’épidémiologie et le rôle des pratiques culturales dans le développement de
l'esca, (iii) les relations entre le climat et les bioagresseurs de la vigne à
l'échelle des territoires.
VOTRE MISSION ET VOS ACTIVITÉS
Vous serez mobilisé pour l’agrégation et la mise en forme des bases de données régionales
existantes et collectées auprès des partenaires régionaux (Action1), puis, à partir de ces
bases de données, vous serez en charge de proposer et de réaliser des tableaux de bord
dynamiques (avec graphiques et cartes) pour visualiser la localisation et caractéristiques
de ce réseau de dispositifs de surveillance et l’incidence de l’esca à l’échelle nationale
(Action 3). Dans le cadre de l’action 3, vous serez également en charge de la réalisation
de tableaux de bord issus de l’Action 2. Celle-ci a pour objectif d’analyser les effets du
climat et des variables parcellaires sur la variation spatio-temporelle de l’occurrence
des maladies du bois ainsi que d’identifier les facteurs climatiques associés au
dépérissement (maladies du bois et mortalité) pour chaque région viticole. Vous serez
chargé de réaliser les tableaux dynamiques présentant les résultats d
es différentes simulations qui seront réalisées à partir des prédictions climatiques
futures dans un but d’établir des cartes de risque du dépérissement dans les différents
bassins viticoles. Vous travaillerez en étroite collaboration avec l’équipe OPE de la
Plateforme d’Épidémiosurveillance en Santé Végétale dans le cadre du Groupe de travail
«Surveillance Épidémiologique du Dépérissement du vignoble», afin de proposer une méthode
pour la collecte, la mise en forme, l’analyse et la visualisation des données “maladies du
bois” à l’échelle nationale et qui pourra être mis au service d’autres problématiques de
la Plateforme ESV. Ces travaux seront réalisés avec des logiciels selon l’état de l’art
(ArcGIS, QGIS, R, Python, ...), dans le cadre d’une science ouverte et reproductible. La
restitution finale se fera sur le Portail Infrastructure de Données Géographiques du
Comité National des Interprofessions des Vins à appellation d�
��origine et à indication géographique du Plan National du Dépérissement du vignoble
(https://observatoire.plan-deperissement-vigne.fr/portail/).
Formations et compétences recherchées
Master/Ingénieur (Bac+5)
Nous recherchons une personne titulaire d’un diplôme d’ingénieur ou d’un master
informatique avec une spécialisation analyse de données géomatiques. Vous disposez de
pratiques et de connaissances avérées sur les bases de données SIG et leurs manipulations.
Vous avez une maîtrise de programmation des API SIG. Vous développez un intérêt pour
travailler en équipe ainsi qu’un sens du collectif et vous aimez être force de
proposition. Un intérêt pour les applications des SIG à la biologie/écologie serait
vivement apprécié ainsi que des connaissances sur la manipulation des données spatiales
sous R ou/et Python.
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les
loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation
professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel
;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.
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