[Job] [Stage] Construction d'indices de dynamique temporelle - Toulouse (31)

Annonce postée par : Fauvel (mathieu.fauvel(a)inrae.fr) ---------------------------------------- Contact : mathieu.fauvel(a)inrae.fr ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ CONSTRUCTION D’INDICES DE DYNAMIQUE TEMPORELLE DES HABITATS À PARTIR DE SÉRIE TEMPORELLE D’IMAGES SENTINEL-2 Stage M2 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 1 Contexte ══════════ Les indices de dynamique temporelle des habitats (/Dynamic Habitat Index-DHI/) représentent la variation du couvert végétal au cours d’une ou plusieurs saisons. Ils sont calculés à partir de séries temporelles d’images satellites, généralement des données MODIS (). Ces indices ont été utilisés pour estimer la diversité en oiseaux dans plusieurs milieux (Canada, Thaïlande) avec des résultats encourageants. Les DHI sont des descripteurs statistiques de la variabilité temporelle d’un pixel sur la saison considérée. Ils sont construit en deux étapes. Tout d’abord, un indice de végétation est calculé à partir de la série temporelle (e.g., NDVI, LAI …). Puis trois variables sont calculées à partir de cet indice sur la période considérée: • Le cumul des valeurs de l’indice; • La valeur minimale observée de l’indice; • Le coefficient de variations de l’indice, calculé comme le rapport entre la déviation standard des valeurs de l’indice et la moyenne des valeurs de l’indice. Actuellement, les DHI sont disponibles pour des données à faible résolution spatiale (1000m/pixel) de types MODIS, voir par exemple . Cette faible résolution limite la finesse des analyses qui peuvent être faite à partir de ces indices. La figure montre un exemple de DHI sur la zone de Toulouse, à la résolution de 1km par 1km par pixel. La disponibilité de série temporelles d’images à haute résolution spatiale Sentinel-2 offre la possibilité de redéfinir ces indices à des résolutions beaucoup plus fines, et ainsi d’améliorer la finesse des analyses. Cependant, la marche à franchir en termes de complexité de traitement pour passer des données MODIS à des données Sentinel-2 requiert des développements spécifiques. 2 Objectif ══════════ La chaîne de traitements `iota'(^2) initialement développée pour le /CES Produit/ og Occupation des SOlsfg (OSO) () propose une infrastructure logicielle permettant le calcul des DHI sur des jeux de donnée massifs, à l’échelle du territoire métropolitain. L’objectif premier de ce stage est de mettre en oeuvre la chaîne de traitement pour produire ces DHI à l’échelle de la France. Plusieurs points méthodologiques devront être résolus lors du passage à l’échelle nationale au cours du stage, comme la gestion de l’échantillonnage temporel irrégulier, la gestion des nuages ou les problèmes de stabilité numérique. Les cartes de DHI produites avec les séries Sentinel-2 seront comparées avec les données issues de MODIS. Le second objectif du stage consiste à un inventaire bibliographique des indices potentiels de biodiversité. Une sélection des indices optiques les plus pertinents sera implémentée dans la chaîne `iota2'(^2). En fonction du profil du candidat recruté, l’écriture d’un module `C++' pour accélérer les traitements sera considéré. Les DHI produits ont vocation à être intégrés au CES og Variables pour la biodiversitéfg. 3 Moyen mis à disposition ═════════════════════════ La personne recrutée aura à sa disposition: • Les séries temporelles d’images Sentinel 2 pré-traitées par le pôle [Theia]. Des séries de 2017, 2018, 2019 et 2020 seront disponibles. • Un compte sur le cluster HPC du CNES. • Une station de travail et un bureau au CESBIO. [Theia] 4 Profil du candidat ════════════════════ Le candidat doit posséder des connaissances solides dans un des domaines suivants: • Traitements des images et des signaux, • Développement informatique scientifique, • Télédétection et géomatique. Un bon niveau d’Anglais est souhaité. La connaissance d’un langage de programmation est obligatoire (Python, R, C/C++ …). Le candidat doit avoir un intérêt pour le développement informatique. Une expérience avec des outils de gestion de version (git) sera appréciée. 5 Détails pratique ══════════════════ • Le montant des indemnités est d’environ 620 euros par mois. • Le stage aura lieu au laboratoire CESBIO. • Début du stage: Février ou Mars 2021, pour une durée de 6 mois. • Pour candidater, envoyez un CV et une lettre de motivation à Mathieu Fauvel, [mathieu.fauvel(a)inrae.fr]. Fournir un lien vers un dépôt personnel github/gitlab est encouragé. [mathieu.fauvel(a)inrae.fr] ---------------------------------------- L'annonce est située https://georezo.net/forum/viewtopic.php?pid=336692#p336692 Pour vous désabonner connectez-vous sur le forum puis Profil / Abonnement -- Association GeoRezo - le portail géomatique https://georezo.net (Message généré automatiquement. Ne pas répondre à ce message, utiliser les coordonnées contenues dans l'annonce)