Message posté par : Pegasus555 (archiinfo2011(a)gmail.com)
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Bonjour,
Je travaille actuellement sur la plateforme open source GAMA. J'utilise une BD créée sur PostgreSQL et le code contient des requêtes géographiques utilisant PostGIS intégrés dans un algorithme génétique (plus précisement pour évaluer les individus)
J'ai exécuté le même code (avec les mêmes paramètres) sur deux machines :
Machine 1 : un I5 2eme génération 2.7 GHz (2 coeurs) / 4 Go de RAM / disque dur HDD/ windows 7 32 bits
Machine 2 : I7 7eme 2.9 GHz (avec turbo Boost 3.5GHz) / 24 Go de RAM / SSD / Win 10 64 bits
Je n'arrive pas a expliquer une chose : bien que la 2eme machine est plus puissante, le temps d'exécution est le même sur les deux machines et parfois la 2eme machine est plus lente.
J'ai bien modifié les paramètres de PostgreSQL (https://public.dalibo.com/exports/formation/manuels/formations/perf1/perf1.…) selon ma machine mais rien n'y change.
Du coté de la plateforme, idem, j'ai modifié les paramètres qu'il fallait.
Avez vous une idée d'où vient le problème ?
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Message posté par : Nicolas Ribot
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Bonjour,
Ca dépend du format: si ce sont des dumps SQL, oui on doit pouvoir tout mettre dans un seul fichier, mais pourquoi ?
en ligne de commande, la restauration de 4 fichiers SQL est rapide:
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Code :
psql -d database -U user -f fichier.sql
-----------------
(si les fichiers sont au format PG Dump, il faut utiliser l'outil pg_restore)
Nicolas
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Message posté par : Seydi Aliou Tall
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Bonjour
Je suis nouveau sur postgres
Je dispose de quatre fichiers de sauvegardes
Je voulais faire une restauration sur pgadmin 3
Je demandais à savoir s'il est possible d'en faire un seul fichier et le restaurer?
Merci
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Message posté par : hadri45
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Bonjour,
Je dois réaliser des croisements de couches forestières afin d'enrichir la base de données des Forêts officielle. Pour cette opération, le mieux est d'utiliser la fonction Union d'ArcGIS mais j'ai l'obligation de réaliser cela sous Postgres/PostGIS. Pour se faire, j'ai donc vu qu'il fallait réaliser cela en 2 étapes avec d'abord l'intersection pour les deux couches qui s'intersectent puis avec INSERT INTO, récupérer celle qui ne s'intersecte pas avec le ST_DIFFERENCE.
Voici le code où je dois réaliser deux croisements tout en gardant les attributs (code_psg,code_onf et tfv) pour des analyses complémentaires.
Ce code me donne le bon résultat mais vu que je dois réaliser ce traitement pour la France entière il me faut l'optimiser le plus possible sachant que sur un département cela prend plus de 2h30 alors que sur ArcGIS le traitement prend 4 minutes.
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Code :
-- TABLE DU CROISEMENT PRO / PSG
DROP TABLE IF EXISTS surface_unitaire_01.propsg_01;
-- 1. Intersection
CREATE TABLE surface_unitaire_01.propsg_01 AS
SELECT o.code_onf, p.code AS code_psg, ST_SetSRID((ST_Dump(ST_Intersection(o.geom, p.geom))).geom, 932006) AS geom
FROM surface_unitaire_01.pro_2018_simple_01 o
INNER JOIN surface_unitaire_01.psg_2018_simple_01 p ON (o.geom && p.geom AND ST_Intersects(o.geom, p.geom));
-- Nettoyage des géométries invalides
DELETE FROM surface_unitaire_01.propsg_01 WHERE ST_GeometryType(geom) != 'ST_Polygon';
CREATE INDEX sp_idx_propsg_01_geom ON surface_unitaire_01.propsg_01 USING GIST (geom);
ANALYZE surface_unitaire_01.propsg_01;
-- 2. Différences PRO - PSG et PSG - PRO
CREATE TEMP TABLE pro_union AS
SELECT code_onf, ST_Union(geom) AS geom
FROM surface_unitaire_01.propsg_01
GROUP BY code_onf;
CREATE INDEX sp_idx_pro_union_geom ON pro_union USING GIST (geom);
ANALYZE pro_union;
CREATE TEMP TABLE psg_union AS
SELECT code_psg, ST_Union(geom) AS geom
FROM surface_unitaire_01.propsg_01
GROUP BY code_psg;
CREATE INDEX sp_idx_psg_union_geom ON psg_union USING GIST (geom);
ANALYZE psg_union;
DROP INDEX surface_unitaire_01.sp_idx_propsg_01_geom;
INSERT INTO surface_unitaire_01.propsg_01
SELECT o.code_onf, NULL::VARCHAR(3) AS code_psg, (ST_Dump(ST_Difference(o.geom, ST_SetSRID(COALESCE(t1.geom, 'GEOMETRYCOLLECTION EMPTY'::GEOMETRY), 932006)))).geom AS geom
FROM surface_unitaire_01.pro_2018_simple_01 o
LEFT JOIN pro_union t1 ON o.code_onf = t1.code_onf
UNION
SELECT NULL::VARCHAR(3) AS code_onf, p.code AS code_psg, (ST_Dump(ST_Difference(p.geom, ST_SetSRID(COALESCE(t2.geom, 'GEOMETRYCOLLECTION EMPTY'::GEOMETRY), 932006)))).geom AS geom
FROM surface_unitaire_01.psg_2018_simple_01 p
LEFT JOIN psg_union t2 ON p.code = t2.code_psg;
-- Nettoyage des géométries invalides
SELECT DISTINCT ST_GeometryType(geom) FROM surface_unitaire_01.propsg_01;
SELECT DISTINCT ST_SRID(geom) FROM surface_unitaire_01.propsg_01;
SELECT COUNT(*) FROM surface_unitaire_01.propsg_01 WHERE NOT ST_IsValid(geom);
DELETE FROM surface_unitaire_01.propsg_01 WHERE ST_GeometryType(geom) != 'ST_Polygon';
CREATE INDEX sp_idx_propsg_01_geom ON surface_unitaire_01.propsg_01 USING GIST (geom);
ANALYZE surface_unitaire_01.propsg_01;
DROP TABLE pro_union;
DROP TABLE psg_union;
-- contrôles de surfaces
SELECT 'couche onf' AS origine, code_onf, SUM(ST_Area(geom)) AS surface_total
FROM surface_unitaire_01.pro_2018_simple_01
GROUP BY origine, code_onf
UNION
SELECT 'croisement' AS origine, code_onf, SUM(ST_Area(geom)) AS surface_total
FROM surface_unitaire_01.propsg_01
GROUP BY origine, code_onf
ORDER BY code_onf, origine;
SELECT 'couche psg' AS origine, code AS code_psg, SUM(ST_Area(geom)) AS surface_total
FROM surface_unitaire_01.psg_2018_simple_01
GROUP BY origine, code_psg
UNION
SELECT 'croisement' AS origine, code_psg, SUM(ST_Area(geom)) AS surface_total
FROM surface_unitaire_01.propsg_01
GROUP BY origine, code_psg
ORDER BY code_psg, origine;
SELECT DISTINCT st_geometrytype(geom)
FROM surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple
SELECT id_foret, ST_NPoints(geom), ST_MemSize(geom)
FROM surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple
ORDER BY ST_NPoints DESC;
SELECT COUNT(*), COUNT(*) FILTER (WHERE ST_MemSize(geom) > 8192)
FROM surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple;
CREATE TABLE surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple_sub AS
SELECT id_foret, tfv, ST_SubDivide(geom) AS geom
FROM surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple;
CREATE INDEX idx_foret_geom_sub_01 ON surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple_sub USING GIST (geom);
CREATE TABLE surface_unitaire_01.propsg_01_sub
AS SELECT ST_SUBDIVIDE(geom) as geom, code_onf,code_psg
FROM surface_unitaire_01.propsg_01
-- TABLE DU CROISEMENT BD_FORET / PRO_PSG
DROP TABLE IF EXISTS surface_unitaire_01.final_cedric_01;
-- 1. Intersection
CREATE TABLE surface_unitaire_01.final_cedric_01 AS
SELECT p.code_onf, p.code_psg, b.tfv, ST_SetSRID((ST_Dump(ST_Intersection(ST_Buffer(p.geom, 0.0000001), b.geom))).geom, 932006) AS geom
FROM surface_unitaire_01.propsg_01 p
INNER JOIN surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple_sub b ON (p.geom && b.geom AND ST_Intersects(p.geom, b.geom));
-- Nettoyage des géométries invalides
SELECT DISTINCT ST_GeometryType(geom) FROM surface_unitaire_01.final_cedric_01;
DELETE FROM surface_unitaire_01.final_cedric_01 WHERE ST_GeometryType(geom) != 'ST_Polygon';
CREATE INDEX sp_idx_final_cedric_01_geom ON surface_unitaire_01.final_cedric_01 USING GIST (geom);
ANALYZE surface_unitaire_01.final_cedric_01;
-- 2. Différences BD_FORET - PRO_PSG et PRO_PSG - BD_FORET
DROP TABLE IF EXISTS pro_psg;
CREATE TEMP TABLE pro_psg AS
SELECT code_onf, code_psg,geom
FROM surface_unitaire_01.final_cedric_01;
CREATE INDEX sp_idx_pro_psg_geom ON pro_psg USING GIST (geom);
ANALYZE pro_psg;
DROP TABLE IF EXISTS tfv;
CREATE TEMP TABLE tfv AS
SELECT tfv, geom
FROM surface_unitaire_01.final_cedric_01;
CREATE INDEX sp_idx_tfv_geom ON tfv USING GIST (geom);
ANALYZE tfv;
DROP INDEX surface_unitaire_01.sp_idx_final_cedric_01_geom;
INSERT INTO surface_unitaire_01.final_cedric_01
SELECT p.code_onf, p.code_psg, NULL::VARCHAR(10) AS tfv, (ST_Dump(ST_Difference(p.geom, ST_SetSRID(COALESCE(t1.geom, 'GEOMETRYCOLLECTION EMPTY'::GEOMETRY), 932006)))).geom AS geom
FROM surface_unitaire_01.propsg_01_sub p
LEFT JOIN pro_psg as t1 ON p.code_onf = t1.code_onf AND p.code_psg = t1.code_psg
UNION
SELECT NULL::VARCHAR(3) AS code_onf, NULL::VARCHAR(3) AS code_psg, t.tfv, (ST_Dump(ST_Difference(t.geom, ST_SetSRID(COALESCE(t2.geom, 'GEOMETRYCOLLECTION EMPTY'::GEOMETRY), 932006)))).geom AS geom
FROM surface_unitaire_01.bd_foret_01_simple_sub t
LEFT JOIN tfv t2 ON t.tfv = t2.tfv;
CREATE INDEX sp_idx_final_cedric_01_geom ON surface_unitaire_01.final_cedric_01 USING GIST (geom);
ANALYZE surface_unitaire_01.propsg_01;
DROP TABLE pro_psg_union;
DROP TABLE IF EXISTS tfv_union;
DROP TABLE tfv;
-----------------
J'ai donc essayé de subdiviser ce qui accélère les temps de traitements mais le plus gros problème reste le dernier ST_DIFFERENCE entre la bd_foret et pro_psg qui est toujours aussi long malgré cette subdivision et ne permet pas de valider le code. J'ai également essayé de transformer les géométries en tuile (MapVector Tile) avec ST_ASMVTGeom mais cela est encore plus long. J'ai également essayé de faire sans le ST_UNION ou ST_COLLECT mais cela ne change pas beaucoup le temps de traitement.
Ma couche principale est de l'ordre de plus de 25000 entités et les autres couches à croiser sont autour de 2000.
Pour la configuration, je suis sous PostgreSQL 12 et PostGIS 3.0.
Auriez-vous donc une idée afin d'optimiser le traitement ?
Merci,
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Message posté par : Nicolas Ribot
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Bonsoir,
PG en tant que tel n'est pas outillé pour accéder à des URL, des API.
Mais il supporte de nombreux langages qui permettent ces accès, à travers des fonctions écrites dans ces langages.
Une solution classique est de développer un serveur d'application (java, javascript, python, php, ...) qui fait les accès à l'API et le lien vers PG/Pgis pour stocker ou manipuler les données.
Je préfère souvent une solution intégrée à PG, soit à travers une fonction qui réalise les accès, soit à travers un FDW (foreign data wrapper). Je vous laisse regarder le FDW Unicorn, par ex, qui permet en python de développer une interface entre le service et PG, permettant d'accèder à l'API à travers du sql (select * from foreign_table_qui_appelle_lapi).
Ca se met en place assez facilement et convient bien si ces appels à l'API doivent etre nombreux et/ou fréquents.
Il existe aussi des FDW génériques qui savent "taper" sur une API ou un web service avec un peu de conf.
Avec une fonction, c'est encore plus simple: vous développez la fonction (par ex en python, langage vraiment pratique pour manipuler les données et disposant de nombreuses API) qui appelle l'API et traite les données.
Voici un exemple de fonction permettant de géocoder des adresses dans PG. Elle se base sur le geocodeur en ligne BANO, prend une requete SQL formatée avec certaines colonnes (rue, num, ville, cp, ...), transmet ces données à l'API du geocodeur, récupère les données (format CSV), les convertit en JSON et les renvoie à PG.
La concision du code Python pour faire tout cela (ca doit pouvoir etre bien plus concis: je suis nul en python...) est remarquable je trouve.
(le code execute la requête passée en param, formate le tout en CSV (en mémoire), puis envoie ce CSV sur l'URL du geocodeur.
Le résultat (CSV) est converti en JSON et renvoyé par la fonction: on peut alors convertir les info JSON en geométries postgis.)
-----------------
Code :
create or replace function geocode_add(query text)
RETURNS setof jsonb as
$$
import csv
import io
from collections import OrderedDict
import requests
import json
with io.BytesIO(b"") as stream:
writer = csv.writer(stream, delimiter=',', quotechar='"', quoting=csv.QUOTE_MINIMAL)
writer.writerow(["ids", "voie", "ville", "cp"])
for row in plpy.cursor(query):
# writes row in csv to csv stream
# Write CSV Header, If you dont need that, remove this line
writer.writerow([row['ids'], row['voie'], row['ville'], row['cp']])
requests_session = requests.Session()
kwargs = {
'data': OrderedDict([
('columns', ['voie', 'ville', 'cp']),
('postcode', 'cp')
]),
'method': 'post',
'files': OrderedDict([
('data', ('addpg.csv',stream.getvalue()))
]),
'stream': True,
'url': 'https://api-adresse.data.gouv.fr/search/csv/'
}
response = requests_session.request(**kwargs)
for row in csv.DictReader(response.text.encode('utf-8').splitlines()):
yield json.dumps(row)
$$ language plpythonu VOLATILE;
-----------------
Elle s'utilise comme cela:
-----------------
Code :
select * from geocode_add('select array_agg(s.id) as ids, voie, ville, cp from table_adresse');
-----------------
Nicolas
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Message posté par : Ricola62
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Bonjour,
est ce que vous savez comment résoudre le problème de plusieurs paramètres dan st_buffer de Postgis?
st_buffer(geom, 100, 'side=right endcap=square') cela ne fonction pas et renvoit juste un buffer coté droit.
Merci d'avance
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Message posté par : Pascal PLUVINET
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Bonjour,
J'ai créé et importé des données dans une base de données PostGIS via l'utilitaire "Gestionnaire de base de données" de QGIS.
J'ai fait ceci en utilisant une connexion Postgis avec le user postgres qui aurait tous les droits sur le schema.
Or une fois importées, les tables (avec ce même user) sont en "read-only".
Cela se voit bien dans PgAdmin4, lorsqu'on fait "View/Edit data", il y a un petit cadena à côté de chaque nom de colonne.
J'ai fait quelque chose de similaire en important des tables depuis des scripts R utilisant la fonction dbWriteTable du package RPostgreSQL". Et c'est la même chose. Le contenu de ces tables n'est pas éditable.
J'ai tenté des requêtes du type :
-----------------
Code :
grant all on monschema.matable to postgres;
-----------------
et ca n'a aucun effet.
Je n'arrive pas à trouver quelle est la contrainte de sécurité qui bloque l'édition.
Merci d'avance pour vos suggestions,
----------------------------------------
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Message posté par : Nicolas Ribot
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Voici un exemple d'appel de la fonction::
-----------------
Code :
select jsonb_pretty(t)
from geocode_add($$select '{1}'::text[] as ids, '6, place du parlement' as voie, 'TOulouse' as ville, '31000' as cp$$) as t;
{
"cp": "31000",
"ids": "['1']",
"voie": "6, place du parlement",
"ville": "TOulouse",
"latitude": "43.593901",
"longitude": "1.44386",
"result_id": "31555_6544_00006",
"result_city": "Toulouse",
"result_name": "Place du Parlement",
"result_type": "housenumber",
"result_label": "6 Place du Parlement 31000 Toulouse",
"result_score": "0.91",
"result_street": "",
"result_context": "31, Haute-Garonne, Occitanie",
"result_oldcity": "",
"result_citycode": "31555",
"result_district": "",
"result_postcode": "31000",
"result_housenumber": "6",
"result_oldcitycode": ""
}
-- et pour en faire une geom postgis en 2154 par ex:
select st_astext(
st_transform(
st_setSRID(
st_makePoint((t->>'longitude')::float, (t->>'latitude')::float), 4326),
2154)
) as geom
from geocode_add($$select '{1}'::text[] as ids, '6, place du parlement' as voie, 'TOulouse' as ville, '31000' as cp$$) as t;
geom
POINT(574306.714913341 6278443.54202644)
-----------------
(dommage, l'API est privée: on ne peut pas tester)
Nico
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Message posté par : Vincent-SIABS
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Bonjour,
débutant avec les triggers j'ai beaucoup progressé grâce à l'aide des membres du forum que je remercie. cf post https://georezo.net/forum/viewtopic.php?id=121987 & https://georezo.net/forum/viewtopic.php?id=121953
Mais je suis encore confronté à un petit soucis qui je pense vient plus de l'organisation de la base de donnée voir de l'ordre de déclenchement des triggers plutôt que d'une erreur dans les triggers en soit. VOilà mon soucis :
J'ai 2 trigger.
Le TRIGGER 1 : remonte dans une table ligne une info "data" contenue dans une table point.
Le TRIGGER 2 : remonte dans la table ligne cette même info "data" pour toutes nouvelles lignes dont le point de départ correspond au point d'arrivée d'une ligne déjà existante.
L'idée derrière cela est de faire "suivre" l'info "data" de façon automatique lors du traçage de mes réseaux.
Quand je n'ai qu'un seul trigger "d'activé" ça fonctionne. Quand "j'active" les 2 triggers seul le TRIGGER 2 fonctionne, le TRIGGER 1 ne fonctionne plus.
TRIGGER 1
-----------------
Code :
CREATE OR REPLACE FUNCTION TRIGGER 1 ()
RETURNS "trigger" AS $$
BEGIN
new.data= (SELECT p.data
FROM table_point as p
WHERE st_dwithin(st_startpoint(new.geom),(p.geom),0.001)
);
RETURN NEW;
END;
$$
LANGUAGE 'plpgsql'VOLATILE;
CREATE TRIGGER TRIGGER 1
BEFORE INSERT OR UPDATE ON table_ligne
FOR EACH ROW EXECUTE PROCEDURE TRIGGER 1 ();
-----------------
TRIGGER 2
-----------------
Code :
CREATE OR REPLACE FUNCTION TRIGGER2 ()
RETURNS "trigger" AS $$
BEGIN
NEW.data=m.data
FROM table_ligne
WHERE st_dwithin(ST_startpoint(new.geom),st_endPoint(m.geom),0.001);
RETURN NEW;
END;
$$
LANGUAGE 'plpgsql'VOLATILE;
CREATE TRIGGER TRIGGER2
BEFORE INSERT OR UPDATE ON table_ligne
FOR EACH ROW EXECUTE PROCEDURE TRIGGER2 ();
-----------------
Existe t'il un moyen de les hiérarchiser ? ou de faire en sorte qu'ils ne se marchent pas sur les pieds ?
Merci de votre aide.
Vincent
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Message posté par : 1pichet
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Bonjour à tous,
Je sui confronté à un problème d'intersection ou de différence entre deux multi-polygone.
Dans le cadre de mon travail j'avais besoin de faire la différence d'une couche de multi-polygones (A) par une autre couches de polygones (B). Pour se faire j'ai commencé par créer une couche (C) union des polygones de la couche B qui intersectent les polygones de la couche A.
Ensuite j'ai réalisé une différence entre les polygones de la couche A avec ceux de la couche C. J'avais fait un lien avec la clé primaire de la table A.
En regardant de plus près le résultat, je me suis aperçu que la différence réalisée sur certains polygones était incomplète. En gros si j'ai un multi-polygone C qui est composé de deux polygones B1 et B2 qui intersectaient bien un multi-polygone A, lorsque je fais St_Difference(A,C) j'obtiens le même résultat que St_difference(A,B1).
Il en va de même pour St_Intersection. La partie B2 du multi-polygone C semble ne pas être vue alors qu’elle chevauche bien le polygone A.
J'ai vérifié la validité des polygones ainsi que le SRID, et les surfaces mais rien à redire.
Lorsque je réalise l'opération suivante St_Difference(A, St_buffer(C,0.01)), là j'obtiens bien le bon résultat.
Je n'ai pas réussi à trouver d'information sur ce problème, et du coup j'aimerais savoir s'il y a un moyen de le contourner sans passer par des buffer.
Merci d'avance pour vos réponses.
PostgreSQL 9.5.24
Postgis 2.2.1
(impossible de demander des versions plus récentes...)
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